物種是生物多樣性研究的基本單位(洪德元, 2016)。世界上有多少個(gè)物種存在、物種是怎樣起源的、各個(gè)物種是如何分布的、它們的分布范圍在過(guò)去、現(xiàn)在和未來(lái)是怎樣變化的等是生物多樣性研究的基本問(wèn)題(Brown, 1995;Hortal et al, 2015)?；卮疬@些問(wèn)題依賴(lài)于大范圍的、高質(zhì)量的關(guān)于物種分布、編目、系統(tǒng)發(fā)育與生活史性狀等方面的數(shù)據(jù)。關(guān)于這些數(shù)據(jù)的收集，至少可以追溯到林奈、達(dá)爾文、華萊士、洪堡等。然而，這些數(shù)據(jù)大多零散地分布在標(biāo)本館、博物館、書(shū)籍、研究報(bào)告和研究論文中。近年來(lái)，隨著生物多樣性信息學(xué)(BiodiversityInformatics)的蓬勃發(fā)展(Soberón & Peterson, 2004; 馬克平, 2014; 張健, 2017)，大量的開(kāi)放數(shù)據(jù)庫(kù)和論文數(shù)據(jù)存儲(chǔ)機(jī)構(gòu)應(yīng)運(yùn)而生。大量的數(shù)據(jù)資源，通過(guò)新的處理模式，在科學(xué)的進(jìn)步和信息資源管理方面，呈現(xiàn)出前所未有的機(jī)遇，為這些數(shù)據(jù)的整理、標(biāo)準(zhǔn)化、共享和深入挖掘等提供了可能(Hampton et al,2013; 張健, 2017)。

圖為航拍的天童植物景觀(guān)（胡健波提供）

生物多樣性數(shù)據(jù)的大量涌現(xiàn)和數(shù)字化一方面為生物多樣性研究者提供了諸多機(jī)遇，有助于我們深入地研究物種起源和進(jìn)化、生物多樣性維持等理論問(wèn)題，也有助于我們快速準(zhǔn)確地應(yīng)對(duì)瀕危物種保護(hù)、保護(hù)區(qū)管理等實(shí)踐問(wèn)題(張健, 2017)。另一方面，也為生物多樣性研究帶來(lái)了很多挑戰(zhàn)。首先，這些數(shù)據(jù)資源零散地分布在不同的網(wǎng)絡(luò)平臺(tái)、研究論文等中，給研究人員的檢索和更新等帶來(lái)了極大的困難。第二，由于生物多樣性本身的復(fù)雜性，研究方法多種多樣，測(cè)量和記錄的信息在不同的研究中也千差萬(wàn)別，這就導(dǎo)致大部分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)結(jié)構(gòu)復(fù)雜、變量繁多，個(gè)人很難在短期內(nèi)對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)有比較全面的了解，很有可能出現(xiàn)對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)的誤用和濫用。第三，這些零散的數(shù)據(jù)庫(kù)之間還存在很多的重復(fù)，導(dǎo)致研究人員花費(fèi)很多時(shí)間和精力來(lái)反復(fù)瀏覽相同的內(nèi)容，或者不知道應(yīng)該如何選擇適合自己研究問(wèn)題的數(shù)據(jù)。綜上所述，如何高效選擇和有效利用這些海量的生物多樣性數(shù)據(jù)資源成為生態(tài)學(xué)家和保護(hù)生物學(xué)家在大數(shù)據(jù)時(shí)代面臨的一大難題。

面對(duì)生物多樣性數(shù)據(jù)庫(kù)資源零散分布的問(wèn)題，本文把與物種有關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)從物種分布、物種編目、系統(tǒng)發(fā)育和生活史性狀四個(gè)方面進(jìn)行分類(lèi)，并在其中選取一些有代表性的數(shù)據(jù)庫(kù)資源，對(duì)其發(fā)展歷程、使用情況、使用方法等進(jìn)行簡(jiǎn)要介紹。鑒于邵廣昭等(2014)已對(duì)海洋生物多樣性的信息資源進(jìn)行了較全面的總結(jié)，我們的介紹將主要集中在陸地生態(tài)系統(tǒng)。另外，生物多樣性的研究也離不開(kāi)與之緊密聯(lián)系的環(huán)境要素，張鳳麟等(在審)對(duì)這方面進(jìn)行了總結(jié)。通過(guò)這些關(guān)于生物多樣性相關(guān)數(shù)據(jù)資源的介紹，既可以為研究人員了解和使用這些數(shù)據(jù)庫(kù)提供橋梁和紐帶，也可以幫助我們了解生物多樣性信息學(xué)的進(jìn)展與前沿，為我國(guó)相關(guān)領(lǐng)域的發(fā)展提供參考。